Програма включає в себе три етапи: реабілітація, адаптація і соціалізація. Всі ці етапи тісно пов’язані між собою, оскільки спрямовані на відновлення людини як цілісної особистості. Програма розрахована на особливу категорію суспільства – жінка і її дитина.

Реабілітаційний центр приймає жінок, що мають нарко- або алкозалежність, що звільнилися з місць позбавлення волі, з дітьми від народження до трьох років.

Метою роботи є можливість показати вихід і дати напрямок тим, хто сам не може впоратися зі сформованими обставинами. Дати шанс, створити умови для успішної соціалізації людини в суспільстві. Три речі які повинна зрозуміти кожна реабілітується жінка до кінця своєї реабілітації: Я ОСОБИСТІСТЬ, Я ЖІНКА, Я МАТИ.

Вся програма реабілітації розділена на два курси. Перший курс-це проживання в реабілітаційному центрі протягом 12 місяців. Курс включає в себе забезпечення, навчання, програмне зміст, режим, координування служителями центру. Другий курс – це проживання вже за межами реабілітаційного центру. Самостійне забезпечення, пошук роботи і житла оформлення дітей до дитячого садка або школи, при бажанні триває зовнішнє координування, консультації, психологічна підтримка.

Під час перебування в реабілітаційному центрі в разі необхідності, жінці надається допомога в оформленні документів (паспорт, допомогу на дитину і подібні). Всі діти перебувають під наглядом дільничного лікаря-педіатра, дотримується календар щеплень, відповідно до норм законодавства України. Жінки знаходяться на реабілітації, в разі необхідності, знаходяться під наглядом лікаря-спеціаліста за профілем захворювання.

Робота реабілітаційного центру побудована у співпраці з усіма соціальними службами. «Будинок Бертіни» з моменту свого заснування тісно і плідно співпрацює з соціальними службами міст України, пенітенціарними установами, а також іншими реабілітаційними центрами.

Програма, за якою працює центр «Будинок Бертіни» побудована на здоровому християнському вченні, заснованому на вірі, яка зцілює не тільки тіло, а й душу.

Мета всієї цієї програми – закласти правильний нуклеотид для побудови відносин з собою та з навколишнім світом.

При надходженні в реабілітаційний центр кожна жінка знайомиться з правилами перебування і підписує договір про виконання всіх режимних моментів на час реабілітації. Після укладення договору, фонд надає ряд соціальних послуг, а саме: матеріальну допомогу, надає тимчасове місце проживання, забезпечує харчуванням і засобами гігієни першої необхідності.

Також кожна жінка має право припинити свою реабілітацію за її бажанням, тобто вона вільна в своїх рішеннях. Єдиною умовою є інформування адміністрації центру про свої наміри.

Програма реабілітації проходить постійні перевірки, корекції і зміни з боку фахівців, для поліпшення і ефективності всього проекту.